Une experte en anthropologie, Temperance Brennan, et son équipe à l'institut Jefferson (une allusion au Smithsonian Institution) est appelée à travailler en collaboration avec le FBI dans le cadre d'enquêtes criminelles, lorsque les méthodes classiques d'identification des corps ont échoué. Temperance travaille à partir des squelettes (d'où son surnom éponyme de la série : Bones, qui signifie « ossements », en anglais). Celle-ci est épaulée par un agent du FBI, Seeley Booth, avec lequel elle entretient des rapports tantôt conflictuels, tantôt complices voire plus. Elle s'appuie également sur son équipe de scientifiques : Angela Monténégro, sa meilleure amie, qui a inventé un logiciel pour reconstituer une scène de crime en images tridimensionnelles ; le Dr Jack Hodgins, expert en insectes, spores et minéraux ainsi que de son assistant, Zack Addy, jeune surdoué.
Une confiance aveugle
Thérapie de couple
Guerre de gang
Le supplice de Prométhée
Une liste de rêves
La dame en blanc
Lune de miel
Le don de la vie
Culpabilité
Mis en boîte
Une équation parfaite
Obsession
Une star inconnue
Echec et Mat
Enfants gâtés
Au nom de la liberté
Mauvaise conduite
La carotte
Le calice de l'assassin
Sauvé par le bong
Jeter un froid
Jusqu'au bout des ongles
Le dernier plongeon
La conspiration (1/3)