Une experte en anthropologie, Temperance Brennan, et son équipe à l'institut Jefferson (une allusion au Smithsonian Institution) est appelée à travailler en collaboration avec le FBI dans le cadre d'enquêtes criminelles, lorsque les méthodes classiques d'identification des corps ont échoué. Temperance travaille à partir des squelettes (d'où son surnom éponyme de la série : Bones, qui signifie « ossements », en anglais). Celle-ci est épaulée par un agent du FBI, Seeley Booth, avec lequel elle entretient des rapports tantôt conflictuels, tantôt complices voire plus. Elle s'appuie également sur son équipe de scientifiques : Angela Monténégro, sa meilleure amie, qui a inventé un logiciel pour reconstituer une scène de crime en images tridimensionnelles ; le Dr Jack Hodgins, expert en insectes, spores et minéraux ainsi que de son assistant, Zack Addy, jeune surdoué.
Les messagers
Les diamants sont éternels
Le jeune prodige
Un bon voisin
Anok
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Combustion spontanée
L’écran de la mort
Noël en famille
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Secret d’état
Apparences trompeuses
Les cornes du diable
Séisme
Première enquête
Le boucher de Burtonsville
L’océan de la vie
Rock n’roll turpitudes
Le cercle de Moonwick
Le procès
La fuite en avant