L'identité du Témoin étant désormais connue, l'ingénieur de la réalité virtuelle mettant fin à l'Armée des 12 Singes, Cole et ses alliés doivent traverser différentes époques de l'histoire pour l'arrêter.
Mère
Les gardiens
Ennemi
Frères
Causalité
Inné
Acquis
Les masques
La voleuse
Le témoin