L'histoire se déroule sur Terre en l'an 2025, bien après « Eureka Seven ». Ao Fukai est un jeune garçon de 13 ans qui vit sur l'île d'Iwato Jima dans l'état indépendant d'Okinawa avec le docteur Toshio Fukai. Alors qu'une société militaire privé nommée « Génération Blue » attaque un Scub Coral apparu sur l'île, il se retrouve mêlé au combat et est contraint d'activer un étrange robot géant transporté par l'Armée japonaise, baptisé « Nirvash ». En même temps, Ao part à la recherche de sa mère et de ses mystérieuses origines…
Born Slippy (Deep Blue)
Appelez-le comme vous voulez (La caverne d'AO)
Toujours en train de combattre (opération secrète)
Walk This Way (Corail végétal)
Serrez-vous (Génération Bleu)
Light My Fire (Noblesse Oblige)
Personne n'est innocent (Bye Bye Angel)
Une nation sous un groove (Blue Thunder)
Dans l'obscurité que nous vivons (ennemi ci-dessous)
Libérez-vous (Le joueur de flûte de Hamelin)
Plateau des Miroirs (Miroir du Monde)
Entrez dans un monde (ciel et terre)
C'est un arc-en-ciel (navire au clair de lune)
Starfire (une autre vérité)
Tête de guerre (secret humanoïde)
Marteau du gardien (phase suivante)
La Vie en Rose (Johansson's Book)
Ne regarde pas en bas (troisième moteur)
Peut-être demain (le jour)
Des jours meilleurs à venir (dernier message)
Monde à monde (Rising Sun)
De galaxie à galaxie (porteurs de corail)
La frontière finale
Portes de l'été