À la suite des précédents événements, Jim Gordon est rétrogradé comme simple policier. Bruce et Alfred dénichent au sein du Manoir une pièce secrète contenant un ordinateur ayant des données sur Wayne Enterprise. Avec l'aide de Lucius Fox, le jeune milliardaire va de découvertes en découvertes : Wayne Enterprise serait à l'origine de manipulations génétiques au cœur d'Indian Hill, une division de l'entreprise en contact avec l'asile d'Arkham que son père voulait fermer définitivement. A la venue d'un nouveau notable puissant nommé Théo Galavan, une vague de crimes déferle sur Gotham. Elle aura de graves répercussions sur la pègre ainsi que ses concitoyens.
Le secret de Thomas Wayne
Les Maniax attaquent
Rira bien qui rira le dernier
La force de frappe
Le bras de la vengeance
Le feu du désespoir
A chacun sa vérité
Duel au sommet
Injustice et manigances
Le fils de Gotham
Du sang sur les mains
Sueurs froides
D'amour et de glace
Tuer le tueur
On ne choisit pas sa famille
Entre quatre murs
Amis ou ennemis
Promesses tenues
Azrael
L'union fait la force
Les soldats du Professeur Strange
Métamorphoses