C'est la guerre... John et les villageois sont contraints de tout quitter pour aller se réfugier là où personne ne pourra les trouver, dans le bunker, la base secrète d'Hero Corp. Hoodwink est de retour à Montréal et il est prêt à tout pour enfin prendre le contrôle du monde. Les super-héros sont partout menacés, les sites de l'agence sont détruits, les quelques survivants vont tenter d'aller se réfugier dans la base secrète. Mac Kormack (le directeur de l'agence) est débordé et complètement dépassé par cette situation de crise, il y a des traîtres à tous les étages. Après les avoir isolés, discrédités et mis à la retraite, il va se rendre compte que les villageois, menés par John et Mary, sont les seuls à pouvoir l'aider à rétablir l'ordre...
La tempête
La leçon
Ex-æquo
La mine
Au pied des murs
Nouveau toit
Intrus
Du bon côté
Servir l'homme
Dix-sept survivants
Retrouvailles
Stratèges
Instructions
Une nouvelle ère - Partie 1
Une nouvelle ère - Partie 2