Plusieurs mois après les évènements de la première saison, Tony Soprano assume le contrôle de la Famille DiMeo. Aussi soudainement qu'il est parti, Big Pussy Bonpensiero revient. Junior Soprano est en prison et Livia Soprano est hospitalisée à la suite de son attaque. Le docteur Melfi a fui à la demande de Tony. La sœur de Tony, Janice Baccalieri, s'installe chez Tony.
S.O.S. Psychiatre
Acharnement thérapeuthique
Au plaisir
Retour aux sources
Cas de conscience
Le Vagabond heureux
La Garce
La Veste
Affaire d'éternité
Dépôt de bilan
Prisonnier chez soi
Le Chevalier blanc dans son armure de satin
Le Palais du rire