Les agents du NCIS poursuivent leurs enquêtes sur des affaires impliquant des militaires de la Navy, qu'ils soient victimes, coupables ou simples témoins. Gibbs et son équipe commencent par s'intéresser au cas d'un homme disparu six mois plus tôt. L'explosion d'une voiture semble reliée à ce mystérieux dossier. Plus tard, c'est la mort d'une femme, tombée du haut d'un bâtiment, qui occupe les spécialistes.
Une nouvelle ère
Les mauvais garçons
Pour quelques pièces d'or
La croisière tigre
Philadelphie
Les poupées russes
La patrie des braves
L'homme de Guantanamo
Une femme de cran
L'arnaqueur
Opération Willoughby
Infiltration
Dos au mur
Double vie
La boîte de Pandore
Le choix d'Ellie
La chambre des secrets
Un devoir de mémoire
Les cavaliers solitaires
Coup de froid
Le droit à l'erreur
À l'état sauvage
Une grande occasion
Un pour tous...