Yûma Kuga est un étudiant étranger qui vient d’arriver dans la ville de Mikado. Osamu Mikumo, un autre élève de sa classe est chargé de s’occuper du nouveau venu, mais le premier jour à la sortie des cours, ils assistent à l’ouverture d’une brèche dans la réalité, et à l’apparition d’un Neighbor, race d’envahisseur qui vient d’un autre monde. Osamu intervient et utilise une arme issue de la technologie ennemie, le Trigger, qui lui permet de faire appel à des pouvoirs spéciaux. Ce jeune étudiant à l'allure docile se révèle être un membre du Border, l'organisation de soldats d'élite qui contient l'invasion des Navers. Mais peu aguerri, Osamu se retrouve en fâcheuse posture et est alors sauvé par le chétif Kuga, lui aussi en possession d'un Trigger… mais d'une puissance sans commune mesure avec celui d'Osamu… Quelle est la véritable identité de Kuga ? Quelle est la raison de sa présence dans la ville de Mikado ?
Les visiteurs venus d'un autre monde
Les Neighbors et les soldats-trions
Les capacités d'Osamu Mikumo
Ai Kitora, agent de l'unité Arashiyama, nº 5 de la classe A
La crème de l'élite, Yûichi Jin
Le Side Effect de Chika Amatori
L'assaut de l'unité Miwa
Le Black Trigger
L'agence nommée Border
La branche Tamakoma
Leurs choix respectifs
Les classe A de la Tamakoma
Les troupes d'élite du Border
L'attacker nº 1, Kei Tachikawa
Fûjin, le Black Trigger
Le futur en mouvement
L'enrôlement au Border
Sôya Kazama VS Osamu Mikumo
Matchs de classe ! Le stratagème de Shun Midorikawa
Duel ! Yûma VS Midorikawa
Le monde des Neighbors
Le début de l'invasion massive
Le pays des dieux, Aftokrator
Les oisillons de Meeden
L'unité la plus forte du Border
Bataille ! Enedora VS l'unité Kazama
La contre-attaque du Border
L'utilisateur d'Organon
Le croisement du futur
Le général ennemi, Hyrein
La détermination d'Osamu Mikumo
La ténacité d'Enedora
La terreur de Hyrein
Fin du combat acharné ! La bataille la plus violente
À la fin de la bataille
Les démunis
Héros et partenaires
Coup d'envoi des matchs de classe B
Les unités Suwa et Arafune
Les débuts de l'unité Mikumo
Le novice éffronté
Kô Murakami de l'équipe Suzunari–1
Le choix de l'unité Nasu
Bataille par mauvais temps
Ce qui détermine la victoire
L'obstination des attackers
La fierté d'un capitaine
Puis, vers le lendemain
Les fugitifs d'un autre monde
L'assaillant sans forme
Les soldats-trions de Xeno
Le soleil couchant de Meeden
Ceux à protéger
L'offensive de Gieve
Dead or Alive
Le mystère de Lilith
Xeno et Lilith
Osamu en captivité
Les deux Black Triggers
L'aventure de Yôtarô
Vérité et mensonges
Gieve et Charon
Le futur qui s'inverse
Le prisonnier d'Aftokrator
Le shooter nº 1, Masataka Ninomiya
Les crocs aiguisés
Match de classe en 1ère poule
La Tamakoma prise pour cible
Mêlée générale
Le devoir du capitaine
Une nouvelle menace
L'unité Mikumo évolue
Vers le futur